Supongo que os habeis dado cuenta de que cada cierto número de reinicios, se realiza una comprobación automática del disco con fsck.

El comando tune2fs nos permite establecer el número de veces que se montará la partición raíz hasta que se produzca una nueva comprobación de disco, deshabilitar el chequeo (se desaconseja), conocer cuantas veces hemos arrancado el sistema desde la última comprobación, etc.

Vamos a ver todo esto con ejemplos prácticos. El comando tune2fs hay que ejecutarlo con sudo:
(NOTA: /dev/sda1 es mi partición raíz, vosotros teneis que modificar los siguientes comandos para indicar la vuestra)

- Cambiar el número de arranques entre chequeo y chequeo a 30:
sudo tune2fs -c 30 /dev/sda1

- Deshabilitar el chequeo (desaconsejado):
sudo tune2fs -c 0 /dev/sda1

- Reiniciar el contador de arranques del sistema desde el último chequeo (aquí la "C" de "-C" es mayúscula. En los dos casos anteriores es minúscula.):
sudo tune2fs -C 0 /dev/sda1

- Hacer el chequeo cada 3 días con independencia del número de veces que entremos en el sistema:
sudo tune2fs -i 3d /dev/sda1

- Hacer el chequeo 1 vez al mes con independencia del número de veces que entremos en el sistema:
sudo tune2fs -i 1m /dev/sda1

- Además, con otro comando (dumpe2fs), podemos saber el número de veces que se ha montado la partición desde la última comprobación del disco ("Mount count"):
sudo dumpe2fs /dev/sda1 | grep count